The King of Fighters '95 segna l'inizio di un arco narrativo che in seguito divenne noto come la "Orochi Saga". Tuttavia, gli unici elementi della Orochi Saga noti in questo gioco sono l'introduzione del rivale di Kyo, Iori Yagami, e l'uso da parte di Rugal del potere di Orochi. Rugal Bernstein, si credeva fosse morto in un'esplosione nel gioco precedente, in realtà era sopravvissuto e aveva inviato inviti alle squadre del gioco precedente firmati semplicemente 'R'. Solo una delle squadre del gioco precedente non partecipò al nuovo torneo: la American Sports Team, ora sostituita dal "Rival Team" composta da Iori Yagami, Billy Kane (da Fatal Fury: King of Fighters) ed Eiji Kisaragi (da Art of Fighting 2). Saisyu Kusanagi, padre di Kyo, appare per la prima volta come lottatore (avendo fatto un cameo non giocabile in KOF '94) come personaggio sub-boss controllato dal computer. Dopo aver sconfitto Saisyu nella modalità arcade, si scopre che Saisyu era stato sottoposto a lavaggio del cervello e che Rugal combatterà di nuovo come boss, ma in una versione potenziata chiamata "Omega Rugal".