La storia contiene quattro capitoli. Nel primo capitolo, "L'inizio", Ark viene introdotto come un ragazzo che vive a Crysta, l'unico villaggio rimasto nel mondo sotterraneo. Tocca una scatola misteriosa che congela tutti i cittadini del villaggio. Scongelando gradualmente gli abitanti del villaggio, Ark riaccende incidentalmente anche i continenti nel mondo superiore distrutto. A quel punto, l’anziano del villaggio gli ordina di visitare il mondo superiore e di far rivivere la vita. Nel secondo capitolo, "La resurrezione del mondo", Ark risorge tutte le piante del mondo rendendo possibile attraversare le montagne della Guiana. Nel secondo passo riporta in vita tutti gli uccelli, il vento, gli animali e, più recentemente, gli esseri umani. Nel terzo capitolo, "La resurrezione del Genio", l’anziano del villaggio appare nel sogno di Ark dicendogli di sostenere l’umanità nel progresso. Ark viaggia di città in città e aiuta la crescita delle città e lo sviluppo delle tecnologie. Ma rianima anche Beruga, uno scienziato che si era messo in uno stato di sonno quando la Terra fu distrutta. Ha una visione di un mondo perfetto in cui la maggior parte delle persone viene uccisa da un virus e solo pochi vivono sul mondo diventando zombie immortali. L’anziano appare di nuovo, dicendo ad Ark che il suo lavoro è fatto e che ora può morire. Ark si rende conto ora che, come umano dalla parte oscura, è stato usato da Dark Gaia per i suoi piani di dominazione del mondo. Kumari, un saggio, teleporta Ark via e gli dice di cercare cinque Pietre Stellari per richiamare il Figlio d’Oro. Ark incontra il proprio Sé della Luce che uccide l’Ark della parte Oscura. Nel quarto e ultimo capitolo, "La resurrezione dell’eroe", Ark nascerà di nuovo come bambino grazie a Light Gaia. Sconfigge Beruga e poi torna nel mondo sotterraneo per sconfiggere Dark Gaia. La vittoria su Dark Gaia distrugge tutta la parte oscura, quindi il mondo sotterraneo con il villaggio Crysta. Sapendo che verrà reincarnato, Ark accetta il suo destino e va a dormire.