Nel tardo degli anni Novanta, conflitti eti­nici in tutto il mondo causano un grande numero di morti e una gran parte del pianeta resta isolata. Decenni dopo, nel 202X, un ragazzo che vive a Neider Tokyo nell'area D-03 riceve improvvisamente un misterioso Programma di Evocazione dei Demoni sul suo COMP da qualcuno chiamato TAKEUCHI, con i demoni che compaiono subito dopo. Dopo essersi fatto strada fino a un edificio misterioso, trova una giovane donna in sonno criogenico, che decide di unirsi a lui. Ci sono tre finali possibili: una fine pessima, una fine normale e il miglior finale.