A nord della città natale di BomberMan, Peace Town, si trova la moderna metropoli Diamond City. Là, il malvagio Carat Diamond e la sua ciurma, lo scienziato Dr. Mook, stanno organizzando un Torneo dei Robot con robot appositamente progettati per le loro capacità di combattimento e di offesa. Desiderando impossessarsi delle avanzate capacità di combattimento di BomberMan, Diamond ha creato un falso BomberMan per recarsi a Peace Town e rapire il vero BomberMan. Consapevole del complotto di Diamond, Black BomberMan parte da solo per affrontare il falso BomberMan. Ma Black BomberMan viene sconfitto e il suo castello viene preso. In qualche modo Black BomberMan scappa e cerca rifugio con White BomberMan, e lo avvisa del malvagio piano di Diamond. Presto, onda su onda di robot nemici iniziano la loro avanzata verso Peace Town. Ora i nostri due eroi devono unirsi per rovesciare il malvagio Diamond.