Questo gioco riduce molte delle aggiunte al gameplay introdotte in Bomberman '94 e Super Bomberman 2 e torna alla formula classica. Per quanto riguarda il multiplayer, il gioco aggiunge molto rispetto al titolo precedente introducendo più personaggi, ognuno dei quali rappresenta un paese della Terra (incluso uno dei villain, Pretty Bomber, nei panni della Francia, che segna il suo primo ingresso come personaggio non ostile). Ci sono anche nuove sequenze cinematiche per la modalità Story, che ruotano attorno alla resurrezione dei Five Dastardly Bombers che erano stati sconfitti in Super Bomberman 2, mentre White Bomber e Black Bomber avventurano attraverso varie stelle a tema elemento in cui i Five stanno causando il caos, sotto il dominio del loro creatore, Bagular. Le grafiche di animazione complessive sono cambiate con la terza incarnazione; a differenza di Super Bomberman 1 e 2, le grafiche della terza incarnazione sono state semplificate e ricordano le grafiche dei giochi Bomberman per il PC Engine, e la maggior parte della musica presente nel gioco è una versione remixata delle colonne sonore di Bomberman precedenti.