Questa versione è diversa dalla sua controparte Genesis. Mentre il gameplay è simile (esplorare i livelli per raccogliere indizi e risolvere il mistero), in questa versione ci sono quattro episodi differenti. Durante una visita al Drabwell Ranch, i fantasmi interrompono i festeggiamenti e la banda deve scoprire chi c'è dietro le infestazioni e perché. Un'altra avventura porta la banda a Deadman's Cove, dove un pirata spettrale ha spaventato i turisti ed è compito di Scooby e della banda fermarlo. Le altre due misteri si svolgono in una fiera e in una casa infestata. I giocatori possono utilizzare l'unica abilità olfattiva di Scooby per trovare indizi. Scooby consuma anche gli Scooby Snacks per ridurre il misuratore della paura. Inoltre c'è una serie di mini-giochi a cui i giocatori possono partecipare, come "Wac-A-Monster" o "Make a Scooby Sandwich". La grafica è fedelmente ricreata per assomigliare alla celebre serie Hanna-Barbera.