In Alternate Reality: The City, sei una delle tante persone che sono state rapite dalla Terra dagli alieni e trasportate in una dimensione alternativa dove vieni gettato in una città strana, ma familiare. La tua missione è esplorare la città e trovare gli indizi che ti condurranno ai tuoi rapitori e ti aiuteranno a tornare a casa. Oltre alle caratteristiche standard di un RPG in prima persona dell'epoca, come abilità, statistiche, punti esperienza e un repertorio di negozi e luoghi da visitare, il gioco offre una valutazione morale del tuo personaggio e, a seconda delle tue azioni, diventi buono o malvagio, e questo influisce su come l'ambiente reagisce a te. Gli incontri non si risolvono necessariamente solo con il sistema di combattimento a turni, ma puoi anche provare a ingannare, affascinare o corrompere gli avversari. La trama è non lineare, ad esempio permettendoti di prendere un lavoro per migliorare una particolare abilità o semplicemente per passare il tempo.