Nella modalità giocatore singolo, l'unico personaggio giocabile è Godzilla. Invece di permettere al giocatore di scegliere i nemici, ogni livello offre al giocatore una scelta tra due avversari. Ad esempio, il primo livello offre al giocatore una scelta tra Anguirus e Rodan. Ogni combattimento è basato sul film da cui è tratto. Ad esempio, il livello di Anguirus vede Godzilla apparire com'era nel 1955, usa i ruggiti di Godzilla di quel film e si svolge nei terreni del Castello di Osaka. Quando il giocatore completa un livello, viene ricompensato con una certa quantità di punti. Più il giocatore si comporta bene nel livello (sconfiggendo l'avversario in poco tempo, quanta salute gli resta, ecc.), maggiore sarà il punteggio ottenuto. Quando il giocatore arriva al livello 6, gli viene nuovamente chiesto di scegliere l'avversario, ma questa volta il giocatore ha fino a sei opzioni tra le quali scegliere; il numero dipende dal punteggio. Il Super X II è sempre disponibile, Mechagodzilla 2 si sblocca a 450.000 punti, Forma Finale di Biollante si sblocca a 500.000 punti, Mecha-King Ghidorah si sblocca a 550.000 punti, Forma Imago di Battra si sblocca a 600.000 punti, e Super Mechagodzilla si sblocca a 650.000 punti.