Sul pianeta Ripple Star vive un gruppo di fate buone e pacifiche. Il pianeta stesso è protetto dal pericolo grazie al potere del grande Crystal, che veglia su Ripple Star. Questo potere, tuttavia, attira l'attenzione di Dark Matter, che desidera usare il grande Crystal per la sua malvagia agenda. La sua gigantesca massa attacca e cerca il Crystal, annerendo il cielo e mandando le fate in panico. In risposta alla minaccia presentata da Dark Matter, la regina di Ripple Star ordina a una fata chiamata Ribbon di portare il Crystal in un luogo sicuro. Ribbon prova a volare via con il Crystal al seguito, ma viene fermata da tre sfere inviate da Dark Matter. Il Crystal si frammenta in 74 frammenti, dispersi su diversi pianeti, e Ribbon si schianta sul Planet Popstar. Kirby trova un frammento e lo dà a Ribbon, e i due partono per trovare gli altri. Una volta che Kirby e i suoi amici raccolgono ogni Crystal Shard e sconfiggono Miracle Matter, Dark Matter fugge da Ripple Star ed esplode. La vittoria è tuttavia breve, poiché Crystal rileva una potente presenza di energia Dark Matter all'interno della Fairy Queen ed espelle Dark Matter da lei, manifestandosi sul pianeta per creare Dark Star. Kirby e i suoi amici si infiltrano in Dark Star, e King Dedede li lancia per sfidare 02. Kirby e Ribbon, armati della loro Shard Gun, hanno distrutto 02 e la Dark Star.