Pokemon Pinball offre tutte le caratteristiche che ti aspetteresti da un gioco di pinball, inclusi tavoli bonus, molti bumper e modi per segnare punteggi enormi. Come in un normale gioco di pinball da videogioco, il pulsante sinistro del D-pad e il pulsante A controllano i flipper, con i trigger R/L usati per scuotere la tavola. La particolarità qui è che tutto è a tema Pokémon. Invece di una pallina, si usa una Poké Ball. Invece dei classici bumper, colpisci la Poké Ball contro altri Pokémon, e l'obiettivo finale è ovviamente catturarli tutti. Il gioco presenta 200 Pokémon, due tavoli principali e il supporto al cavo di collegamento.