Dopo che Samus aveva completato la sua missione ed eliminato l'intera popolazione di Metroid su SR388, come ordinato dalla Galactic Federation (senza il Metroid Hatchling, che lei soprannominò "Baby"), portò il Hatchling alla Ceres Space Colony per la ricerca. Tuttavia, poco dopo la sua partenza, ricevette un segnale di soccorso dalla Station e tornò per investigare. Quando Samus arrivò all'Space Science Academy dove il Baby era stato studiato, trovò tutti gli scienziati massacrati e l'unità di contenimento che ospitava il Baby scomparsa. Esplorando ulteriormente la Station, trovò il Baby in una piccola capsula. Mentre si avvicinava, Ridley apparve e afferrò la capsula. Dopo un breve scontro, Samus respinse Ridley, e lui attivò una sequenza di autodistruzione per distruggere Ceres. Dopo essere riuscita a fuggire dall'esplosione, Ridley fuggì su Zebes, e Samus lo inseguì.