HotD2:
Il gioco segue gli eventi fittizi del 26 febbraio 2000, quattordici mesi dopo l'incidente della Dimora Curien in The House of the Dead.
L'agente AMS G è scomparso e l'ultima posizione nota è Venezia, Italia. La città di Venezia diventa caotica quando si verifica una strana esplosione di zombi. Agenti americani dell'AMS James Taylor e Gary Stewart vengono inviati, insieme ad Amy Crystal e Harry Harris, per indagare ed evacuare la popolazione. Incontrano improvvisamente lo Zeal birichino, che aveva recentemente avuto a che fare con G. Trovato G vivo ma ferito, James e Gary conversano con lui e G consegna loro un diario di campo che mostra i boss e i punti deboli. I due si trovano poi di fronte a un'enorme orda di non morti, simile a quella dell'incidente della Dimora Curien. Proseguono, cercando di salvare i civili della città dagli zombi.
HotD3:
L'infestazione di zombi si è diffusa in tutto il mondo, riducendo il pianeta in desolazione e la civiltà in crollo.
Nel 2019 (16 anni dagli eventi di The House of the Dead 4), una forza paramilitare guidata dall'agente AMS in pensione Thomas Rogan infiltra l'EFI Research Facility, un centro di ricerca precedentemente di proprietà del dottor Roy Curien, situato in un luogo non identificato in Europa o in Nord America, per indagare su ciò che ha causato il crollo del mondo. Durante la missione, l'intero team viene ucciso, finché lui e il suo vice, il capitano Dan Taylor, restano. Quando riescono a trovare la risposta in un gigantesco laboratorio, Death, un gigantesco mutante che funge da guardia di sicurezza della struttura, uccide Taylor e ferisce Rogan. Mentre combattono per rimanere in vita, Rogan viene avvicinato da una figura non identificata con un abbigliamento semi-aziendale che offre aiuto. Il contatto con lui viene perso.
Due settimane dopo, il 31 ottobre, la figlia di Rogan, Lisa, accompagnata dal suo ex socio, l'agente semi-pensionato "G", arriva alla struttura per soccorrerlo. Mentre si muovono attraverso la struttura, respingono orde di creature non morte, prima di incontrare Death, con cui combattono due volte. Più avanti combattono un bradipo deforme, The Fool, e una pianta mutata tentacolare chiamata The Sun. Per la strada, Lisa si confida con "G" su come deve vivere all'ombra del suo famoso padre e su quanto spesso sia oggetto del suo confronto.