L'anno è 200X. Un gruppo di robot che si autodefiniscono le Dimensions ha attaccato Symphony City, una città in cui persone e robot vivevano in pace. Anche senza testimoni, colui che guidava le Dimensions con potere travolgente era un robot simile a Rockman. Si diceva che fosse una persona oscura e malvagia completamente ossessionata dalla distruzione. Rockman, che udì questa notizia nel laboratorio di Right, si diresse sul posto nonostante fosse in manutenzione. Allo stesso tempo, Wily vide il Rockman oscuro e, per accertare il mistero, inviò Forte in città. Chi è davvero questo Rockman oscuro?! Rockman Shadow: "Mi chiamo Rockman Shadow! Sono un robot dal grande potere. Non perdonerò chiunque non mi obbedisca!" Rockman: "Basta ferire tutti! Ma chi diavolo sei? Come può essere che assomigli così tanto a me?" Forte: "Sono venuto per porre fine alla vita di Rockman che odio ancora oggi, ma in qualche modo questa situazione è diversa dal solito." Rockman: "Forte, non ho tempo per preoccuparmi di questo ora. Devo fermare quei robot!" Forte: "Ch! Non si può fare nulla, il laboratorio di Wily è vicino a questa città. Non porterò avanti qui la nostra guerra di logoramento!" Per il momento, i due hanno dovuto mettere da parte le loro differenze e affrontare la nuova minaccia delle Dimensions. Dopo averne sconfitti tutti, affrontano il loro leader, Rockman Shadow. Lui discute brevemente di Quint, una versione di Rockman che proveniva in passato dal futuro ma fu catturata e modificata dal Dott. Wily. A seconda di quale personaggio lo affronterà alla fine, egli rivelerà una versione diversa della sua origine, ma alla fine sarà liberato dalla sua agonia, rivelando che voleva essere distrutto per fermare i suoi desideri distruttivi.