Uzumaki segue una studentessa delle scuole superiori, Kirie Goshima; il suo fidanzato, Shuichi Saito; e i cittadini della piccola e tranquilla città giapponese di Kurouzu-cho (Black Vortex Town), che è avvolta da eventi soprannaturali legati alle spirali. Man mano che la storia prosegue, Kirie e Shuichi assistono a come la maledizione delle spirali influenzi le persone intorno a loro, portando i cittadini a diventare o ossessionati dalle spirali o paranoici riguardo ad esse, inclusa la trasformazione in mostri grotteschi quali contorcono i loro corpi, facendo comportare le gravide come zanzare, risuscitando i morti e mutando la maggior parte dei cittadini in lumache. La maledizione colpisce anche l'ambiente di Kurouzu, poiché contemporaneamente genera trombe d'aria e vortici, trasformando in particolare il faro abbandonato in un forno rovente, mentre chi lo guarda cammina in cerchio.