Prima degli eventi di Splinter Cell: Essentials, Sam Fisher deve fare i conti con la recente perdita della figlia a causa di un incidente causato dall’ubriachezza al volante. Ma ha poco tempo per elaborare il lutto, poiché dovrà presto intraprendere un incarico sotto copertura che lo costringe a fingersi un criminale per infiltrarsi in un gruppo terroristico con base negli Stati Uniti. Questa nuova missione costringe Fisher in una nuova e molto pericolosa zona grigia, dove la linea tra giusto e sbagliato si sfuma oltre ciò a cui è abituato Fisher, e migliaia di vite innocenti sono in gioco.