Beyond a Steel Sky si svolge sulla Terra in un lontano futuro, in cui mega-città, come Union City, esistono in un mondo devastato da guerre nucleari e disastri. Mentre coloro che risiedono in tali città sono soggetti alle loro leggi e alle loro visioni della società da parte delle grandi corporazioni, coloro che risiedono al di fuori di esse nelle vaste desolazioni (note come The Gap) vivono all'interno di comunità tribali che sopravvivono grazie al commercio, alla caccia e ad altre abilità, con tali persone che i cittadini delle città chiamano Gaplanders. La storia del gioco è ambientata dieci anni dopo gli eventi di Beneath a Steel Sky, e si concentra sulla vita di Robert Foster — un Gaplander che risiedeva a Union City da bambino, finché alcuni eventi non lo costrinsero all'esilio contro la sua volontà e fu cresciuto da una tribù locale che lo trovò. La trama, scritta da Charles Cecil, si concentra sul concetto di come un'IA potrebbe interpretare una direttiva primaria per rendere felici le persone.