La versione console di Spider-Man 2 è un videogioco d'azione-avventura in terza persona, ambientato in un mondo aperto ispirato a New York City e composto da Manhattan, Roosevelt Island, Ellis Island e Liberty Island. I giocatori assumono il ruolo di Spider-Man e completano missioni — scenari lineari con obiettivi predefiniti — per progredire nella storia. La storia è suddivisa in più capitoli, ciascuno con i propri obiettivi, come acquistare potenziamenti per Spider-Man, o ottenere un certo numero di punti eroe completando missioni secondarie. Queste missioni secondarie sono affidate da pedoni casuali sulla mappa del gioco e consistono principalmente nel combattere criminali, fermare auto in corsa saltando sopra di esse e prendendole a pugni, portare feriti all'ospedale, o salvare lavoratori edili dalla caduta che potrebbe rivelarsi fatale. Ogni capitolo include almeno una missione narrativa legata alla trama principale. I giocatori possono dondolarsi sulle ragnatele, strisciare sui muri e combattere i nemici usando una varietà di combo. Possono utilizzare il "Senso del Ragno" di Spider-Man per rallentare il tempo e schivare gli attacchi in arrivo, inclusi i colpi di fuoco. Questa versione del gioco è stata considerata innovativa per quell'epoca grazie agli algoritmi basati sulla fisica che simulano il dondolio delle ragnatele di Spider-Man in tre dimensioni, creando una nuova meccanica di gioco diversa dal salto o dal volo tipici dei precedenti giochi di Spider-Man. Il combattimento è molto più complesso, poiché richiede di cronometrare con cura gli attacchi e le schivate del giocatore. Dopo aver completato la storia principale, si sblocca una modalità bonus all'interno di un magazzino, dove il giocatore può affrontare ondate di nemici e boss della trama principale, oltre a un antagonista esclusivo: Calypso.