Sono quattro millenni prima del Galactic Empire e centinaia di Jedi Knights sono caduti in battaglia contro i Sith spietati. Sei l'ultima speranza dell'Jedi Order. Riesci a padroneggiare il potere incredibile della Force nel tuo percorso per salvare la Republic? O cadrai nell'attrazione del lato oscuro? Eroe o cattivo, salvatore o conquistatore... solo tu determinerai il destino dell'intera galassia! L'ex Jedi Darth Malak, un Dark Lord of the Sith e l'ex apprendista di Darth Revan, ha scatenato un'un'armata Sith contro la Republic. L'aggressione di Malak ha lasciato i Jedi sparsi e vulnerabili; molti Jedi Knights sono caduti in battaglia e altri hanno giurato fedeltà a Malak. Il gioco si apre con il personaggio del giocatore - il giocatore può scegliere un volto ed essere maschio o femmina (canonicalmente un maschio) - che si risveglia a bordo della nave della Republic, Endar Spire, che è sotto attacco dalle forze di Malak. Il personaggio del giocatore, man mano, riunisce compagni e ricostruisce il proprio passato mentre cerca di fermare Malak. Il gioco fa parte di Star Wars Legends Universe.