Essendo un titolo d'azione, il gioco inizia proprio nel momento in cui Indy si prepara a usare per la prima volta il suo fedele whip: a Monte Carlo, dopo aver reclutato l'audace ex studentessa Sophie come alleata e aver determinato la posizione di antichi dischi necessari per aprire la porta alla città perduta di Atlantide. La maggior parte dell'azione si svolge in visuale isometrica, anche se ci sono alcune variazioni lungo il percorso per mantenere vivo l'interesse. Ci sono anche alcuni elementi da avventura, come l'inventario di Indy che puoi riempire con vari oggetti da usare (ad esempio, denaro per acquistare oggetti). Tuttavia, sono soprattutto semplici e sono pensati solo per alleviare la tensione dell'azione frenetica.